腫瘤基因診斷對于腫瘤的精準治療至關重要，而高質量的核酸提取是確保基因診斷準確性的基礎。通過對不同類型腫瘤樣本（新鮮組織、FFPE樣本及血漿ctDNA）的提取實驗，對比傳統酚氯仿法，分析博清生物核酸提取儀在核酸得率、純度及下游應用兼容性等方面的表現。結果顯示，博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀在各方面均展現出顯著優勢，尤其適用于臨床腫瘤基因診斷的高通量、高質量需求，為腫瘤精準醫療提供了有力的技術支持。
腫瘤的發生發展與基因變異密切相關，腫瘤基因診斷能夠為臨床治療提供關鍵的指導信息，實現精準醫療。核酸提取作為腫瘤基因診斷流程的起始和關鍵步驟，其提取質量直接影響后續基因檢測的準確性與可靠性。傳統的核酸提取方法如酚氯仿法，雖應用歷史較長，但存在操作繁瑣、耗時長、易引入污染以及對操作人員技能要求高等缺點，難以滿足現代臨床腫瘤基因診斷快速、高通量且準確的需求。
隨著技術的不斷進步，基于磁珠法的自動化核酸提取技術逐漸成為主流。磁珠法利用磁珠表面的特殊官能團與核酸分子特異性結合，在磁場作用下實現核酸的分離與純化，具有操作簡便、自動化程度高、提取效率高以及交叉污染風險低等顯著優勢。博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀正是采用了先進的磁珠吸附分離技術，能夠高效處理多種樣本類型，包括腫瘤組織、FFPE（福爾馬林固定石蠟包埋）樣本以及血漿中的循環腫瘤DNA（ctDNA）等。本研究通過一系列實驗，系統評估博清生物核酸提取儀在腫瘤基因診斷中的實際應用性能，為其在臨床實踐中的推廣應用提供科學依據。
一、材料與方法
（一）儀器設備
博清生物核酸提取儀：型號BHT-16T，博清生物科技（南京）有限公司產品。該儀器采用磁珠吸附分離技術，具備精準的溫度控制模塊，可實現自動化核酸提取流程，一次最多可處理16個樣本。
傳統核酸提取相關設備：包括高速離心機用于酚氯仿法中的離心步驟；移液器用于精確移取試劑和樣本；渦旋振蕩器用于混合樣本與試劑。
核酸定量與檢測儀器：熒光計用于精確測定核酸濃度；分光光度計用于檢測核酸純度，通過測量吸光度計算A260/A280和A260/A230比值；熒光定量PCR儀用于評估提取核酸的下游PCR擴增性能。
（二）樣本來源
新鮮腫瘤組織樣本：共收集30例，均來自手術切除的腫瘤患者，樣本類型涵蓋肺癌、乳腺癌、結直腸癌等常見腫瘤類型。在手術切除后立即將組織樣本置于液氮中速凍，并保存于-80℃冰箱直至實驗使用。
FFPE樣本：選取20例已存檔的FFPE樣本，同樣涉及多種腫瘤類型。
血漿ctDNA樣本：采集15例腫瘤患者的外周血樣本，通過EDTA抗凝管收集。血液樣本采集后2小時內進行離心處理，分離出血漿，并進一步通過專用試劑盒富集血漿中的ctDNA。
（三）試劑耗材
核酸提取試劑盒：配套博清生物核酸提取儀使用，包含磁珠、裂解液、洗滌液、洗脫液等完整試劑體系，適用于多種樣本類型的核酸提取。
酚氯仿法試劑：包括酚氯仿異戊醇混合液（25:24:1）、無水乙醇、75%乙醇、3M醋酸鈉（pH 5.2）、RNase A等，均為分析純級別。
其他試劑：Qubit dsDNA HS Assay Kit 用于熒光計對DNA濃度的測定；實時熒光定量PCR所需的Master Mix、引物及探針，針對腫瘤相關基因進行定制合成。
二、核酸提取儀技術優勢分析
博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀采用的磁珠吸附分離技術具有獨特的優勢。在新鮮腫瘤組織樣本提取中，精準的溫度控制模塊能夠在裂解階段確保細胞充分裂解，同時避免核酸過度降解；在洗滌步驟中，通過優化磁珠與核酸的結合條件以及洗滌液的配方，能夠高效去除雜質，提高核酸純度和得率。對于FFPE樣本，其專門設計的脫蠟和裂解程序，能夠有效打破核酸與蛋白質之間的交聯，使核酸充分釋放，從而顯著提高FFPE樣本的核酸提取效率。在血漿ctDNA 提取方面，博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀利用磁珠對ctDNA的特異性吸附，結合自動化的洗滌和洗脫流程，大大提高了ctDNA的回收率和純度，減少了操作過程中的人為誤差和樣本損失。
三、研究局限性與展望
本研究雖然系統評估了博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀在腫瘤基因診斷中的性能，但仍存在一定局限性。例如，實驗樣本主要集中在常見腫瘤類型，對于一些罕見腫瘤類型的適用性還需進一步驗證；在通量方面，目前該儀器一次最多處理16 樣本，在大規模篩查中可能稍顯不足。未來，可進一步擴大樣本類型和數量，深入研究博清生物核酸提取儀在不同腫瘤類型及復雜臨床樣本中的應用效果。同時，研發團隊可考慮通過技術升級，如增加模塊或改進儀器設計，提高儀器的通量，以更好地滿足臨床大規模檢測的需求。此外，結合新興的分子診斷技術，如數字PCR、二代測序等，進一步優化核酸提取流程，提高檢測的精準度和全面性，為腫瘤基因診斷提供更完善的解決方案。
通過對新鮮腫瘤組織樣本、FFPE樣本及血漿ctDNA 樣本的提取實驗，全面評估了博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀在腫瘤基因診斷中的性能。結果表明，博清生物科技（南京）有限公司研發的核酸提取儀在核酸得率、純度及下游應用兼容性等方面均顯著優于傳統酚氯仿法。該儀器在腫瘤基因診斷中具有重要的應用價值。
